Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFNP31947 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFNP31947 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFNP31947 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFNP31947 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFNP31947 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms