Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXC12P31275 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms