Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms