Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms