Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTFRP26992 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms