Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA4P25789 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA4P25789 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms