Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCNE1P24864 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNE1P24864 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms