Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms