Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT1P21579 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT1P21579 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms