Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SDSP20132 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDSP20132 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDSP20132 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDSP20132 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDSP20132 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDSP20132 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDSP20132 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDSP20132 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDSP20132 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDSP20132 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms