Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL3P19876 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms