Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC3P19447 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC3P19447 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms