Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FLT1P17948 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FLT1P17948 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FLT1P17948 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FLT1P17948 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FLT1P17948 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLT1P17948 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLT1P17948 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLT1P17948 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLT1P17948 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLT1P17948 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLT1P17948 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLT1P17948 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLT1P17948 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLT1P17948 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLT1P17948 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLT1P17948 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FLT1P17948 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FLT1P17948 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
FLT1P17948 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT1P17948 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLT1P17948 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms