Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCG2P13521 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCG2P13521 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCG2P13521 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCG2P13521 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms