Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LYL1P12980 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LYL1P12980 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms