Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP3P12645 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP3P12645 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP3P12645 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms