Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms