Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HSP90AB1P08238 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms