Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM2P07951 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPM2P07951 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPM2P07951 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPM2P07951 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPM2P07951 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPM2P07951 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms