Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPBP07199 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPBP07199 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPBP07199 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPBP07199 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPBP07199 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPBP07199 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPBP07199 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPBP07199 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPBP07199 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPBP07199 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPBP07199 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPBP07199 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPBP07199 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPBP07199 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms