Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGAP02671 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGAP02671 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGAP02671 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGAP02671 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGAP02671 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
FGAP02671 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGAP02671 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGAP02671 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGAP02671 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGAP02671 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGAP02671 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms