Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-AP01891 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms