Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR1AO95602 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms