Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB6O95452 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB6O95452 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB6O95452 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB6O95452 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB6O95452 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB6O95452 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB6O95452 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB6O95452 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB6O95452 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB6O95452 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms