Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBF1O95248 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBF1O95248 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBF1O95248 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SBF1O95248 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SBF1O95248 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBF1O95248 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBF1O95248 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBF1O95248 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBF1O95248 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBF1O95248 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SBF1O95248 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SBF1O95248 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SBF1O95248 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SBF1O95248 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SBF1O95248 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBF1O95248 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBF1O95248 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SBF1O95248 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBF1O95248 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBF1O95248 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBF1O95248 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBF1O95248 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SBF1O95248 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms