Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RHOBTB3O94955 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms