Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECM2O94769 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECM2O94769 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECM2O94769 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM2O94769 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM2O94769 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM2O94769 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECM2O94769 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECM2O94769 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECM2O94769 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms