Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRMUO75648 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRMUO75648 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms