Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NPHP4O75161 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NPHP4O75161 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms