Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms