Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNC1O60486 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms