Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAK2O60296 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms