Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6DO43924 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6DO43924 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6DO43924 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6DO43924 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6DO43924 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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PDE6DO43924 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6DO43924 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6DO43924 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6DO43924 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6DO43924 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6DO43924 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6DO43924 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6DO43924 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6DO43924 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6DO43924 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6DO43924 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6DO43924 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6DO43924 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6DO43924 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6DO43924 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6DO43924 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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