Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP9BO43861 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms