Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRNO43815 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRNO43815 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRNO43815 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRNO43815 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRNO43815 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STRNO43815 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRNO43815 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRNO43815 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRNO43815 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRNO43815 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRNO43815 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRNO43815 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRNO43815 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRNO43815 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRNO43815 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRNO43815 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms