Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYNMO15061 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNMO15061 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNMO15061 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNMO15061 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNMO15061 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNMO15061 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNMO15061 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYNMO15061 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYNMO15061 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYNMO15061 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYNMO15061 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYNMO15061 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms