Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNAP23O00161 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNAP23O00161 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms