Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms