Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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