Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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USP17L12C9JPN9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L12C9JPN9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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