Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L13C9JLJ4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L13C9JLJ4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms