Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PATL2C9JE40 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms