Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
B4DEV8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
B4DEV8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
B4DEV8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms