Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM1B2RUZ4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM1B2RUZ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms