Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms