Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERINC4A6NH21 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms