Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POTEFA5A3E0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POTEFA5A3E0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms