Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMD3A2A2Y4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMD3A2A2Y4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms