Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms