Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms